重视研究不同课程之间差异 探究型课程本身与基础型差异是很大的，研究两者之间的差异对探究型课程的教学设计，把握探究型课程的内涵有着重要的意义。
①教学设计的主要依据不同。基础型课程在教学设计时主要依据是教材、教参、考纲和练习册等作为参考。而探究型课程本身是校本课程，是教师自己开发的课程。教师在教学设计时的依据和参考资料是非常有限的，主要依据是，《探究型课程实施指南》和本校的《探究型课程实施方案》。所以教师在教学设计过程中要认真的学习和研究这两个文件，根据本校的《探究型课程实施方案》的设计意图，结合本校和学生的实际情况，在此基础上制定出学期或学年的教学目标，当然，具体的设计每个课题或每节课的教学目标时，要与本校的阶段教学目标、学习内容相吻合。如：我校是市生命教育实验学校，学校重视把生命教育熔入到探究性学习之中去，并把这方面的要求明确的写入到探究型课程之中，要求任课教师在开展探究性学习活动过程中，关注生命教育为内容的小课题学习活动，所以，教师在进行教学设计过程中要注意与学生一起，来开发生命教育为内容的小课题，以实现本校的《探究型课程实施方案》的目标要求。当然，教师在没有现成的备课资料做参考，依靠的是任课教师的创造性劳动，及教研组或备课组教师间的相互合作来完成的，对于习惯了利用教材和教参备课的广大教师来说，确实困难是很大的。
②教学目标的要求是不同。从探究型课程和基础型课程比较来看，探究型课程对学生显性的知识目标和学习结果要求不高，这与基础型课程的知识目标要求是有较大区别的。有时是很难做出具体的规定，应该说对学生的知识掌握要求是有一定弹性的，需要教师在教学设计时认真的思考、研究和把握，具体情况要具体的分析和对待。如：在查找资料的一类课题，在教学过程中只要学生学习态度认真，积极参与对资料的查找，能掌握查找资料的基本方法，虽然资料查找的不是很多、内容也不是很深的，但在评价时也可以是优和良。探究型课程对学生隐性的学习目标要求，却是比较高的，注重学生方法的掌握、关注学习过程参与和学习能力的提高，重视学生情感、态度和价值观的变化。但对其评价是比较困难的，因为，学生的情感变化，在一节课的学习过程中是很难看出来的，所以，从这一点上来看，对教师教学能力的要求，反而要比基础型课程要求的高，应该说教师进行有效教学设计，是要经过自己的创造性劳动才能完成的，但由于探究型课程开发的时间比较晚，教师有关方面的经验积累的都比较少，而且本学科任课教师流动性相对又比较大的，所以对于许多任课教师来说进行有效教学设计，并不是一件很轻松的事。
③课堂教学方法和学法不同。探究型课程课堂教学方法是多种多样，有一定的开放性，又是生成性很强的课程。而且，学生学习方式与基础型课程也有很大不同，强调学生开展自主性、合作性和探究性学习，引导学生在学习中感悟和体验学习的过程，这些动态的和开放的教学过程都给教学设计增加了难度。重要的是方法的使用要服从教学目标的需要，要紧紧围绕教学目标来选择教学方法和学习方法，因此，在探索探究型课程的教学设计的时候，要关注和研究不同课程之间的差异性，有利于把握符合探究型课程特点的教学设计。